yy44 пишет: Я не уверен что это правильно, потому что любая джакарта, запущенная через установленный утм с другой джакартой подключается к утм первоначальной установки. Если я не прав скажите как это проверить.
Поменяйте ключ, как я написал выше. Отправьте запрос на продукцию или контрагента из подразделения, которому принадлежит новая джакарта. Запрос уйдет в ФСРАР с ФСРАРИД нового подразделения (т.к. ЕГАИСИК именно так сформирует файл запроса). Если вернется ответ с ФСРАР (а вернется он на ФСРАРИД, который был указан в файле-запросе), то всё работает.
При установке из параметров джакарты сохраняется в конфигурации только пароли PKI и ГОСТ. Еще как вариант можно установить несколько УТМ в разные папки, и запускать тот, чей ключ вставлен - но можно запутаться.